С сентября 1941г. механик авиационный 511 скоростного бомбардировочного авиаполка (командир полка- майор Бабанов Анатолий Александрович).

Награжден медалью «За оборону Москвы».

С марта 1942г. по июнь 1943г. полк проходил переучивание по программе курса разведывательной авиации. Переименован в 511 отдельный разведывательный авиаполк.

К январю 1944г. обеспечил 105 боевых самолетовылетов. Приказом от 04 января 1944г. старший сержант Злобин награжден медалью «За боевые заслуги».

В конце марта 1944г. командиром полка назначен подполковник Берман Семен Давидович.

08 января 1945г. самолет командира эскадрильи майора Гришаноав Александра Васильевича вернулся с боевого вылета с разбитым хвостовым оперением. В течение ночи и следующего дня самолет был восстановлен.

04 апреля 1945г. самолет командира звена Костарева Михаила Васильевича вернулся с боевого задания с сильными повреждениями хвостового оперения и левой шасси. На второй день ремонт был завершен.

За успешное обеспечение 122 боевых вылетов Сергей Емельянович приказом от 16 июня 1945г. награжден орденом Красной Звезды.

Награжден медалью «За победу над Германией в Великой Отечественной войне 1941-1945 гг.».