В 1939 году был призван в ряды Красной Армии в г. Хабаровск. Прослужив 6 месяцев, был назначен командиром отделения связи.

     В октябре 1941 года 78-ю стрелковую дивизию под командованием полковника А.П.Белобородова, в которой служил Хасан, отправили на западный фронт. Панфиловцы входили в 16-ю сибирскую армию Рокоссовского и дрались бок о бок с земляками из дивизии Белобородова на Волокаламско-Истринском направлении.

     Белобородовцы были поставлены на самый выступ. Для всех главный бой грянул 16 ноября. Именно в этот день шагнул в бессмертие политрук Клочков, оставив потомству крылатую фразу: "Великая Россия, а отступать некуда. Позади Москва!"

    16 ноября противник обрушился на дивизию Белобородова. От взрывов земля ходила ходуном. Против одной дивизии Белобородова- четыре немецких соединения: две пехотные дивизии, укрупненная мотогренадерская дивизия "Рейх" и 10-я танковая дивизия.

    За героизм, высокие боевые качества и умелые действия в битве под Москвой дивизия в ноябре 1941 года была преобразована в 9-ю гвардейскую, а ее командиру присвоено воинское звание генерал-майора.

    Многие солдаты и офицеры были награждены орденами и медалями, в их числе был и Хасан Зайнагабутдинов, награжденный медалью "За оборону Москвы".

    В 1942 году Хасан был ранен  и отправлен в госпиталь. После лечения был командирован на учебу младших командиров в г. Оренбург, после чего получил звание младший лейтенанта.

    В 1943 году принимал участие в битве на Курской дуге. Во время сражения на курской дуге с Хасаном произошел очень знаменательный случай. Летевшие на задание советские штурмовики ошибочно приняли дивизию, преследовавшую противника, за колонну немцев. Штурмовики начали снижаться для атаки. Быстро сообразив, в считанные минуты Хасан со своим взводом выставил опознавательные знаки в виде большого флага, тем самым целая дивизия советских солдат и офицеров была спасена от уничтожения. За этот подвиг Хасан Хаеретдинович был награжден орденом Красного Знамени. В боях на Курской дуге был снова ранен, опять попал в госпиталь.

    После лечения был направлен уже на Прибалтийский фронт. Борьба за Прибалтику была продолжительной и носила исключительно ожесточенный характер. Немцы имели в Прибалтике довольно крупную группировку войск.

    В 1944 году советские войска, преследуя части немецко-фашистских войск, подошли к небольшому латвийскому городу. В тот момент не было сплошной линии фронта. Четыре офицера , в том числе Хасан Хаеретдинович вошли в этот городок и увидели большую колонну немецких войск.Расположившись друг от друга на расстоянии 100 м, офицеры решили принять бой. Открыв огонь из автоматов, они уничтожили большую часть немецких солдат, остальные фрицы в панике бежали. За проявленное мужество и героизм офицеры были удостоены наград, Хасан Зайнагабутдинов был награжден орденом Отечественной войны.

    Хасан Хаеретдинович окончание войны встретил под г. Кенигсберг. После Победы он участвовал в борьбе с бандитизмом в Латвии. Во время патрулирования города Хасаном Хаеретдиновичем  с другими бойцами была обезоружена и арестована группа бандитов, готовивших диверсию.

    Домой Хасан Хаеретдинович вернулся только в 1947 году, в звании лейтенанта.