Пономарев Алексей Петрович был призван в ряды Красной Армии  11 сентября 1939 года. Воинскую присягу принял 5 ноября 1939 года при 227 Стрелковом полку.

Проходил военную службу в 227 стрелковом полку в воинской должности «стрелок» с сентября 1939 по март 1940 г., затем был переведен в 229 стрелковый полк, в котором находился по сентябрь 1942 года. С сентября 1942 г. присвоено воинское звание «сержант» и должность «командир стрелкового отделения» 252 стрелкового полка, в котором находился до декабря 1946 года. Демобилизован 14 декабря 1946 г. на основании Указа Президиума Верховного Совета СССР 20.03.1946.

В Великой Отечественной войне принимал участие с сентября 1942 года по 1 августа 1943 г.

Награжден медалями «За Победу над Германией», «20 лет  Победы в ВОВ 1941-1945 гг.» и многими другими памятными медалями.