В Красной Армии с сентября 1929г.

В 1931г. принят в ряды ВКП(б).

Окончил военную школу летчиков.

Участник Советско-финляндской войны.

Указом Президиума ВС СССР от 07 апреля 1940г. был награжден орденом Красного Знамени.

С первых дней войны на Западном фронте, вероятно, в составе 90 дальнебомбардировочного авиаполка.

В 1942г. командовал 454 и 12 бомбардировочными авиаполками.

С 15 июля 1942г. личный состав 12 бомбардировочного авиаполка находился в Омске, на авиазаводе №166 изучал материальную часть самолета Ту-2.

С 07 октября 1942г. по 18 января 1943г. летный состав проходил практическую программу по переучиванию на самолет Ту-2.

С 21 января по 06 февраля полк совершил перелет по маршруту Омск- Свердловск- Казань- Ярославль.

До 26 апреля экипажи отрабатывали бомбометание, воздушную стрельбу и маршрутные полеты. 

С 26 апреля по 07 мая- перелет Ярославль- Красный Кут- Невинномысск.

До 23 мая- боевая подготовка.

23 мая- перелет на аэродром Кореневская (Краснодарский край).

24 мая 1943г. майор Козырев ведущим звена Ту-2 совершил боевой вылет с 18-31 до 19-40, в 19-15 с высоты 2380м. сбросил 9 авиабомб ФАБ-100 и 2 авиабомбы ФАБ-250 на позиции противника на высоте 121,0. Был обстрелян зенитной артиллерией противника.

26 мая 1943г. ведущим группы из 10 самолетов совершил боевой вылет с 05-25 до 06-51, в 06-14 с высоты 2100м. сбросил 9 авиабомб ФАБ-100 и 2 авиабомбы ФАБ-250 на артиллерийские батареи противника на окраине станицы Киевская, был обстрелян зенитной артиллерией.

С 01 июня по 09 июля личный состав полка занимался командирской учебой, производил учебные вылеты на отработку техники пилотирования и бомбометания.

С 09 по 13 июля полк совершил перелет по маршруту Кореновская- Энгельс- Сушковка.

К 23 июля материальная часть 21 самолета была подготовлена к выполнению дальнейших боевых задач. 

Полк перебазировался на аэродром Ржев.

13 августа 1943г. экипаж бомбардировщика Ту-2- командир майор Козырев Петр Харитонович, штурман Калашников Яков Андреевич, флагманский стрелок-радист старшина Мельников Григорий Васильевич,  воздушный стрелок старший сержант Левченко Григорий Васильевич- ведущим 13 Ту-2 вылетел на бомбардировку командного пункта и войск противника в пос.Духовщина.  Колонна состояла из 3 групп. Бомбардировала центральную часть поселка. Была обстреляна зенитной артиллерией. В период с 10-30 до 10-32 наши самолеты были атакованы истребителями ФВ-190 (Фокке-Вульф), до 10 истребителей. В воздушном бою были сбиты два истребителя и два Ту-2. Один Ту-2 в районе аэродрома Ржев из-за разрушения хвостового оперения свалился в штопор. Экипаж погиб.

13 сентября 1943г. экипаж: Козырев, Калашников, Мельников, Левченко- ведущим девятки Ту-2 бомбардировал войска противника в район Демидово. Произвел фотографирование результатов бомбардировки.

15 сентября полк закончил боевую работу на Калининском фронте.

Петр Харитонович с начала Отечественной войны совершил 13 успешных боевых вылетов. В период нахождения в резерве был назначен инспектором-летчиком по технике пилотирования 334 бомбардировочной авиадивизии, в состав которой входил 12 бомбардировочный авиаполк.

С июля 1944г. части дивизии участвовали в прорыве линии Маннергейма и в освобождении Выборга на Ленинградском фронте.

На 3 Белорусском- бомбардировал станцию Минск, не дав возможности противнику эвакуировать 50 эшелонов с техникой. На 1 Прибалтийском фронте полк наносил удары по войскам противника; по железнодорожным станциям Малта, Митава, Мейтене, Оига, Полин; по переправам в районах Дриса и Друя; по аэродрому Эйзере. 

Приказом от 03 августа 1944г. майор Козырев был награжден орденом Отечественной войны I степени.

Весной 1945г. экипажи дивизии наносили удары по объектам противника в Кенигсберге, в портах Пиллау и Розенберг, по укреплениям в районе Хайлигенбайль и Данцига.

С 16 апреля участвовали в Берлинской операции. Бомбардировали Берлин. 

Майор Козырев совершил еще 19 успешных боевых вылетов.

Приказом от 10 июля 1945г. был награжден орденом Красного Знамени.

В июне дивизия перебазировалась на один из подмосковных аэродромов. Участвовала в подготовке к воздушной части Парада Победы. Из-за плохой погоды воздушная часть была отменена.

В июле дивизия перелетела в Монголию

Участвовала в Советско-японской войне. Бомбардировала станции Ванемяо и Солунь, вела воздушную разведку.

Майор Козырев был награжден медалями «За оборону Москвы», «За оборону Кавказа», «За взятие Кенигсберга», «За взятие Берлина», «За победу над Германией в Великой Отечественной войне 1941-1945 гг.», «За победу над Японией».

За долголетнюю и безупречную службу в 1944г. награжден орденом Красной Звезды, в 1949г.- третьим орденом Красного Знамени, в 1951г.- орденом Ленина.

Полковник Козырев был уволен в запас 12 октября 1955г.

В честь 40-летия Победы награжден орденом Отечественной войны II степени.