В 1939г. окончил среднюю школу.

С 21 ноября 1939г. курсант 6 авиаэскадрильи Харьковского военного авиационного училища летнабов и штурманов.

23 января 1940г. принял военную присягу.

28 ноября 1940г., по окончанию училища, присвоено звание младший лейтенант. Назначен младшим летнабом (летчиком-наблюдателем) 208 скоростного бомбардировочного авиаполка.

С июля 1942г. курсант Военного авиационного училища разведчиков ВВС Красной Армии (ВАУР), г.Давлеканово (Башкирия). 

17 июня 1943г., после окончания училища, направлен в 15 отдельный запасной разведывательный авиаполк.

Затем, был направлен в 8 отдельную дальнюю разведывательную авиаэскадрилью Волховского фронта.

06 ноября 1943г. присвоено звание лейтенант. 

Эскадрилья была обращена на формирование 742 разведывательного авиаполка.

15 ноября 1943г. Степан Алексеевич назначен летнабом 742 разведывательного авиаполка. Полк имел на вооружении самолеты Пе-2.

02 февраля 1944г. экипаж самолета Пе-2; летчик младший лейтенант Кирилов Виктор Петрович, летнаб лейтенант Коротких Степан Алексеевич, воздушный стрелок-радист старший сержант Малышев Николай Васильевич- выполнил разведку войск и аэродромов противника по маршруту Тулебля- Дно- Сольцы- Шимск.

09 февраля экипаж Кирилов, Коротких, Малышев вел разведку в районах Шимск, Медведь, Николаево, Новоселье, Гривочки. Из-за ухудшения метеоусловий задание выполнил частично. 

16 февраля экипаж выполнял разведку в районах Дно, Остров, Псков, Новоселье, Шимск. В районе Пскова самолет был обстрелян зенитной артиллерией. Летчик был ранен осколком снаряда в ногу. Степан Алексеевич помог летчику довести самолет до оперативного аэродрома и совершить посадку.

В этот день полк перебазировался с аэродрома Коломенка на аэродром Ветрянка.

К 20 февраля 1944г. Степан Алексеевич совершил 13 успешных боевых вылетов на разведку. Был представлен к ордену Красного Знамени. Приказом от 26 февраля 1944г. награжден орденом Отечественной войны II степени.

09 марта экипаж: летчик младший лейтенант Нагоркин Герман Львович, летнаб лейтенант Коротких Степан Алексеевич, воздушный стрелок-радист сержант Коновалов Валентин Гордеевич- выполнил разведку побережья Чудского озера от пункта Лиркула (восточнее Тарту, Эстония), бомбардировал железнодорожную станцию Реола.

10 марта экипаж Нагоркин, Коротких, Коновалов выполнял разведку в районах Петсери (совр. Песоры), Алуксне, Гульбине, Псков. Из-за ухудшения метеоусловий задание выполнил частично.

Вторым вылетом экипаж выполнял разведку от пункта Елини до Псковского озера. Из-за плохих метеоусловий задание не выполнил. По расчету времени сбросил бомбы в районе станции Петсери.

19 марта 1944г. экипаж Нагоркин, Коротких, Коновалов в 15-35 вылетел на разведку аэродромов и взлетно-посадочных площадок противника на участке Тарту- Петсери (Печоры). С вылета экипаж не вернулся.