В Красной Армии с октября 1936г.

Участник Советско-финляндской войны.

С июля 1941г.- на фронтах Отечественной войны.

В августе 1941г. был тяжело ранен.

В 1942г. принят в ряды ВКП(б), партбилет №4886259.

На Центральном фронте 29 августа 1943г. лейтенант Клюкин получил легкое ранение.

До 09 октября 1943г. находился на излечении в эвакогоспитале ЭГ 3334.

К лету 1944г.- командир 1 роты моторизованного батальона автоматчиков 95 танковой бригады. Командир батальона- гвардии капитан Целуйко Дмитрий Савельевич.

С конца июня 1944г. участвовала в разгроме Жлобинской группировки противника, вела наступление на Минск, Барановичи, Брест, участвовала в боях в Польше.

Рота Сергея Ивановича была придана 142 танковому батальону бригады. В боях под Бобруйском рота уничтожила до 700 гитлеровцев, подбила 4 бронетранспортера и до 60 автомашин.

10 июля старший лейтенант Клюкин был представлен к ордену Красного Знамени. Приказ о награждении от 08 сентября 1944г.

В январе 1945г., переправившись на западный берег Вислы, бригада наступала к Одеру.

В период боев с 14 по 21 января рота капитана Клюкина уничтожила 8 противотанковых орудий, 67 автомашин с военными грузами, более 240 гитлеровцев.

Сергей Иванович был представлен к ордену Александра Невского. Приказом от 09 февраля 1945г. награжден орденом Отечественной войны I степени.

В феврале бригада вела бои в Померании.

В начале марта наступала на г.Альтдамм.

Во второй половине апреля и в начале мая 1945г. участвовала в Берлинской операции и штурме Берлина.

Сергей Иванович был награжден медалями «За освобождение Варшавы», «За взятие Берлина», «За победу над Германией в Великой Отечественной войне 1941-1945 гг.».

Уволен в запас 23 октября 1945г.