С ноября 1939г. курсант военного авиационного училища летнабов и штурманов (возможно, Харьковского).

28 ноября 1940г., по окончанию училища, присвоено звание младший лейтенант.

Служил младшим летнабом в составе 201 скоростного бомбардировочного авиаполка (Ленинградский военный округ).

К февралю 1942г. стрелок-бомбардир 2 авиаэскадрильи 718 ночного легкого бомбардировочного авиаполка. Летал в экипаже самолета У-2.

К маю 1942г. лейтенант Губенко выполнил 106 боевых вылетов. Был представлен к ордену Красного Знамени. Приказом от 09 сентября 1942г. был награжден орденом Красной Звезды.

В связи с реорганизацией полка был переведен в состав 742 отдельного разведывательного авиаполка. На вооружении полк имел самолеты Пе-2.

Вел боевую работу на Крымском, Северо-Кавказском, Волховском, Ленинградском и 3 Прибалтийском фронтах.

В составе полка старший летнаб старший лейтенант Губенко выполнил 37 боевых вылетов на разведку и 175 боевых вылетов на транспортировку грузов и бомбардировку войск противника.

Приказом от 11 июня 1945г. был награжден орденом Отечественной войны I степени.

За долголетнюю и безупречную службу в 1950г. награжден медалью «За боевые заслуги», в 1956г.- орденом Красной Звезды.

Капитан Губенко был уволен в запас 08 февраля 1961г.