10 июня 1942г. направлен в 85 запасной стрелковый полк.

07 июля 1942г. убыл из полка в составе маршевой роты №1280.

31 февраля 1943г. был ранен на Харьковском направлении.

13 июня- под Белгородом.

С июля 1943г. командир отделения 1 стрелкового батальона 575 стрелкового полка 161 стрелковой дивизии.

В бою у с.Рясное уничтожил 2 гитлеровцев.

Приказом от 17 августа 1943г. старший сержант Чайников был награжден медалью «За отвагу».

Был ранен в начале августа в Сумской области. Поэтому награду получить не успел.

К 17 августа 1943г. старший сержант Чайников находился на излечении в эвакогоспитале ЭГ 1348.

К октябрю- помощник командира взвода мотострелково-пулеметного батальона 59 гвардейской танковой бригады.

08 октября в бою на западном берегу Днепра за с.Великий Букрин участвовал в отражении двух контратак противника, уничтожив 6 гитлеровцев.

Приказом от 29 октября 1943г. гвардии старший сержант Чайников был награжден второй медалью «За отвагу».

Награду не получил- в следующем наградном листе указано- «наград не имеет», а звание- красноармеец.мПри этом, указан номер билета ВЛКСМ.

К маю 1944г. Иван Трофимович разведчик взвода пешей разведки 89 стрелкового полка 23 стрелковой дивизии.

С 14 марта части дивизии вели наступление в направлении д.Озераны (Туровский р-н, Полесская обл.).

Не сумев овладеть деревней, с 01 апреля перешли к обороне.

06 мая в 10-00 полковая разведка в составе 31 человека сделала засаду на дороге между Хлупин и Млынок. Напав на группу из 12 гитлеровцев, разведчики захватили в плен солдата 8 роты 2 батальона 930 охранного полка, остальных уничтожили.

Приказом от 17 мая 1944г. красноармеец Чайников был награжден третьей медалью «За отвагу».

18 мая 1944г. в 16-40 в 3км. севернее высоты 137,1 немецкая разведгруппа, состоявшая из 8 человек, переодетых в красноармейскую форму, пыталась вести разведку с целью захвата пленного. Группой разведчиков 89 стрелкового полка в 2км. южнее Сторожовцы немецкая разведка была ликвидирована- убито 5 человек, 3 захвачены в плен. Пленные принадлежат 9 роте 2 батальона 3 полка «Бранденбург»- немецкие фельдфебель и солдат, третий- русский.

За участие в разгроме немецкой разведгруппы красноармеец Чайников приказом от 31 мая 1944г. был награжден четвертой медалью «За отвагу».

08 июня 1944г. разведгруппа из 25 человек (в составе группы входил и Иван Трофимович) под командованием старшины Филатова Владимира Васильевича выдвинулась за линию фронта в район Рычев для установления наличия минных полей противника и захвата контрольного пленного. 11 июня разведчики были обнаружены, дважды обстреляны. Противник пытался преследовать группы, но потеряв след, прекратил поиск.

14 июня разведчики организовали очередную засаду в районе с.Коротичи. В 11-00 наблюдатели Бердников Александр Егорович и Шакалий Василий Ильич заметили группу из 11 человек, вооруженных ручным пулеметом. 3 автоматами и винтовками, которая, переправившись через р.Ствига, двигалась в направлении засады. Пропустив немцев, разведчики из засады открыли огонь. Оставшиеся в живых немцы, открыли ответный огонь. Старшина Филатов приказал уничтожить сопротивлявшихся солдат, сам с разведчиками Бердниковым Александром Егоровичем, Дробным Тарасом Григорьевичем и Шакалий Василием Ильичем бросился к ближайшему немцу. Обезоружив «фрица», разведчики оттащили его к условленному месту сбора. Немцы, укрывшись в канаве. Продолжали вести огонь из ручного пулемета. Филатов приказал разведчикам Швабу Владимиру Порфирьевичу и Пархоменко Кузьме Григорьевичу уничтожить их. Немцы были подорваны гранатами. Группа, имея одного раненого, с пленным (из 613 охранного полка 203 охранной дивизии) отошла в район с.Рубрань. 

22 июня Иван Трофимович вместе с разведчиками Жулиным Валентином Павловичем, Полозовым Василием Михайловичем, Трениным Владимиром Павловичем и Чернышевич несли службу по охране командного пункта полка. Выполнил задание по захвату в плен троих солдат противника.

Приказом от 08 июля 1944г. был награжден пятой медалью «За отвагу».

В конце июня 1944г. началась операция «Багратион». Полк в составе дивизии участвовал в прорыве немецкой обороны. 

Дивизия прошла с боями через Пинск, Пружаны, в район Белостока; участвовала в боях под Ригой, Елгавой и Щауляй.

27 сентября 1944г. в бою за селение Завида (Латвия) красноармеец Чайников огнем автомата уничтожил 3 солдат противника, 2 взял в плен.

Приказом от 17 октября 1944г. был награжден орденом Красной Звезды.

Сержант Чайников умер от ран 24 октября 1944г. в 61 отдельном медико-санитарном батальоне.

Был похоронен в братской могиле в районе хутора Вецпакули (Латвия). Перезахоронен на воинском братском кладбище в пос.Вайнеде (Лиепайский р-н, Латвия).