Он отправил семью в Баку и написал заявление в военный комиссариат с просьбой отправить его на фронт добровольцем. В конце 1941 — начале 1942 года на базе Северо-Западного фронта была создана 52-я стрелковая бригада, батальонным комиссаром которой был назначен майор Алиев Мевлан.

В мае 1942 года назначен заместителем командира 780-го артиллерийского полка, также воевал в составе 207-й стрелковой дивизии Донского и Сталинградского фронтов. Гвардии майор М. Алиев начал участвовать в боях под Сталинградом (ныне Волгоград) 13 сентября 1942 года в должности командира артиллерии. В ноябре того же года он был ранен в обе ноги в городе Сталинграде. Но, несмотря на это, бои продолжаются.

В 1943–1944 годах М. Алиев продолжил воевать в должности заместителя командира дивизиона по артиллерии политической части 54-й стрелковой дивизии 27-й гвардейской. Майор Мевлан Алиев, командовавший стрелковым полком в 1944–1945 годах, был ранен в правую ногу в районе реки Висла в Польше в июне 1944 года. В ноябре того же года он получил контузию во время боев в районе реки Нарва в Эстонии.

В феврале 1945 года майор Мевлан Алиев был назначен военным комендантом округа Шверин города Бильзен, став первым азербайджанцем, вставшим на стражу победы, одержанной в Германии. Проживая в Германии вместе с семьей, Мевлан Алиев в последующие годы работал помощником военного коменданта по сельскому хозяйству в городе Бланкербург Магдебургского округа, а в 1946–1947 годах — начальником планово-учетного отдела Военной комендатуры Магдебургского округа в Венигероде.