В ноябре 1941 года был мобилизован комиссаром отряда народного ополчения из г. Вельска Архангельской области.

В марте 1942 года прибыл на Карельский фронт. Награждён медалью «За оборону Ленинграда».

В составе кавалерийского корпуса генерала Белова принимал активное участие в освобождении городов Россоши, Валуек, Харькова, в Курско-Белгородской операции. За бой у станции Прохоровка награждён медалью «За боевые заслуги». Принимал участие в форсировании Днепра, освобождал Киев.

От Киева до Берлина Зайцев П.П. прошёл в составе Третьей Гвардейской танковой армии заместителем командира отдельного мотострелкового батальона. Был дважды ранен. Награждён медалями: «За победу над Германией», «За взятие Берлина», «За освобождение Праги». В Берлине Зайцеву П.П. был вручён Орден Боевого Красного знамени.

Войну закончил в Праге в мае 1945 года, где принимал участие в уничтожении последней фашистской группировки.

Демобилизован в 1946 году в звании подполковника.