Призван по мобилизации 22 июля 1941г. Ухтомским райвоенкоматом. Направлен в Орехово-Зуево.

Летом 1942г. направлен в г.Балахна, где формировалась 279 стрелковая дивизия.

Зачислен стрелком в состав комендантского взвода штаба дивизии.

С сентября 1942г. дивизия вела бои на Калининском фронте. В конце 1942г. выведена в резерв из-под г.Белый.

В январе 1943г. переброшена под Сталинград. Вела бои с частями группы армии «Дон», пытавшихся прорвать кольцо окружения к армии Паулюса.

Затем, дивизии участвовала в боях на Донбассе, в освобождении Ворошиловграда, Славяносербска, Лисичанска.

08 сентября дивизии присвоено почетное наименование «Лисичанская».

Приказом от 26 сентября 1943г. красноармеец Калинин был награжден медалью «За боевые заслуги».

В начале 1944г. дивизия участвовала в освобождении Крыма.

Михаил Степанович был тяжело ранен.

После лечения в госпитале получил отпуск по болезни.

10 июля 1944г., после прохождения военно-медицинской комиссии, направлен Перовским горвоенкоматом на военно-пересыльный пункт Московского облвоенкомата.

11 июля в составе команды военнослужащих направлен в воинскую часть 96933 г.Коломна.

С 21 июля курсант 1 учебного артиллерийского полка.

В сентябре 1944г. направлен в формировавшийся в Минском учебном артиллерийском лагере 1135 легкий артиллерийский полка 169 легкой артиллерийской бригады.

Назначен командиром орудия.

С 10 по 14 ноября были проведены учебные стрельбы.

08 декабря бригада эшелонами отправилась по маршруту: Минск- Барановичи- Брест- Луков (Польша).

Дивизия совершила 80-километровый марш в западном направлении.

В конце декабря части дивизии переправились через Вислу и заняли позиции на Магнушевском плацдарме, южнее Варшавы.

К 13 января 1945г. дивизия была готова к началу наступления 1 Белорусского фронта.

14 января в 08-30 началась артподготовка, через 25 минут, вслед за огневым валом, вперед пошли стрелковые части. Общая продолжительность артподготовки составила 2ч. 35мин. Наступление развивалось в юго-западном направлении на г.Радом. 1135 легкий артиллерийский полк продвигался вместе с подразделениями 47 гвардейской стрелковой дивизии. 

В первый день наступления были заняты первый и второй эшелоны обороны противника, отбиты две контратаки.

К 08-00 15 января противник отошел к третьему оборонительному эшелону. В 08-00 дивизия начала 40-минутную артподготовку, после которой, пехота выбила противника с занимаемого рубежа. 1135 легкий артиллерийский полк своим огнем уничтожил 2 самоходных орудия, 3 орудия и до 60 солдат и офицеров противника.

16 января был взят г.Едлинск. Ппротивник, сбитый с позиций на шоссейной дороге Варшава- Радом, сосредоточил в районе д.Домбрувка-Подлежна до 2 полков пехоты с 10 самоходными орудиями и перешел в контратаку. После 2-часового боя группировка противника была окружена, а к 19-00, полностью разгромлена.

 перешел в контратаку.

В бою погиб сержант Калинин. Был похоронен у д.Домбрувка-Подлежна (д.Дабровка-Подлежна, пол. Dąbrówka Podłężna).