В Красной Армии с 1938г.

Вероятно, окончил ШМАС (школа младших авиаспециалистов).

Служил в Забайкалье, в 32 скоростном бомбардировочном авиаполку. Полк имел на вооружении самолеты СБ.

После начала войны полк был переброшен на Западный фронт.

16 июля 1941г. в составе 30 самолетов СБ прибыл на аэродром Стародуб.

17 июля в период с 10-10 до 14-00 экипажи полка совершили 16 самолетовылетов на бомбардировку железнодорожных узлов Минск и Молодечно. С задания не вернулись 6 экипажей. Среди них, экипаж 1 авиаэскадрильи полка: пилот младший лейтенант Лучкин Виктор Иванович, стрелок-бомбардир лейтенант Забков Александр Васильевич, воздушный стрелок-радист сержант Бубнов Александр Федорович. Вероятно, что пилот погиб. Лейтенант Забков был тяжело ранен. Сержант Бубнов вернулся в полк.

02 августа 5 экипажей бомбардировали колонны танков на дороге Кричев- Рославль. При выходе от цели были атакованы 12 истребителями Ме-109 (Мессершмитт). 4 СБ были сбиты, среди них, самолет экипажа: пилот младший лейтенант Ширков Дмитрий Васильевич, стрелок-бомбардир старшина Баранов Сергей Григорьевич, Бубнов. Экипаж покинул самолет на парашютах.

В конце сентября полк был выведен на доукомплектование и переучивание на самолет Пе-2. Преобразован в 32 пикирующий бомбардировочный авиаполк.

На самолетах СБ Алексей Федорович совершил 8 боевых вылетов.

В конце июня полк из Иркутска начал перелет на запад.

На фронте с 06 июля 1942г.

06 июля шесть Пе-2 бомбардировали войска противника в районе с.Землянск. При подходе к цели группа была встречена более 20 истребителями Ме-109. Над целью обстреляна зенитной артиллерией. Был подбит самолет экипажа: командир звена старший лейтенант Межак Эдвин Эмильевич, стрелок-бомбардир лейтенант Потанин Александр Трофимович, старший сержант Бубнов. Пилот посадил горящий самолет в районе Усмани. Он и штурман получили ожоги, сержант Бубнов- невредим.

С конца июля полк перешел на разведывательные вылеты.

30 июля 1942г. экипаж: командир полка майор Щенников Николай Павлович, штурман полка капитан Ведюнин Яков Алексеевич, Бубнов- ведущим звена (3 самолета) выполнил разведку в районах Голая, Снова, Новосильское, Кондрашовка. Произвел бомбардировку автомашин противника.

К концу сентября 1942г. старший сержант Бубнов совершил 12 успешных боевых вылетов на самолете Пе-2. Был представлен к ордену Красного Знамени. Приказом от 18 декабря 1942г. награжден орденом Красной Звезды. 

28 октября экипаж Щенников, штурман полка капитан Баранов Николай Васильевич, Бубнов выполнил разведку районов Мценск, Брянск, Карачев.

В конце ноября полк был преобразован в 32 отдельный разведывательный авиаполк. 

01 декабря экипаж: летчик старшина Брегадзе Григорий Милитонович, Баранов, Бубнов- выполнил разведку районов Фатеж, Курск, Касторное.

16 декабря экипаж Щенников, Баранов, Бубнов выполнил разведку районов Болхов, Брянск, Карачев.

26 января 1943г. экипаж: Журавлев, Баранов, Бубнов выполнил разведку районов Малоархангельск, Змиевка, Кромы, Фатеж.

27 января экипаж Щенников, Баранов, Бубнов выполнил разведку автодорог в районе Мценска, Касторной.

28 января- Космодемьянск, Знаменское, Котовский Колодезь.

06 февраля- Малоархангельск, Прогресс, Поныри.

24 февраля экипаж Брегадзе, Баранов, Бубнов выполнил разведку автодорог и железнодорожных станций Комаричи, Середина Буда, Шостка, Севск.

08 марта экипаж Брегадзе, штурман звена старший лейтенант Зарубин Николай Сергеевич, Бубнов выполнил разведку  по маршруту Орел, Болхов, Хотынец, Карачев, Шаблыкино. 

12 марта экипаж вернулся через 47мин. после вылета из-за течи бензина. Вторым вылетом выполнил разведку в районах Мценск, Болхов, Брянск, Карачев.

12 мая экипаж: командир звена старший лейтенант Чичкаленко Моисей Ефимович, Баранов, Бубнов выполнил разведку в районах Думчино, Болхов, Ульяново.

13 мая экипаж: летчик младший лейтенант Берестов Тихон Михайлович, летнаб младший лейтенант Хрусталев Павел Иванович (18 августа 1945г. присвоено звание Герой Советского Союза, посмертно), Бубнов выполнил разведку в районах Болхов, Ульяново, Карачев.

13 июня экипаж: летчик старшина Лященко (Ляшенко) Николай Кириллович, летнаб младший лейтенант Марюшкин Борис Александрович, Бубнов выполнил разведку в районах Болхов, Ульяново, Хотынец.

14 июня- Брянск, Карачев, Болхов.

15 июня 1943г. экипаж самолета Пе-2 №2015: Лященко, Марюшкин, Бубнов- вылетел на разведку района Ульяново, Брянск, Крачев, Орел, Болхов. При пересечении линии фронта сообщил об этом в радиограмме. Больше экипаж на связь не выходил, с задания не возвратился.

Младший лейтенант Марюшкин попал в плен. Дважды пытался бежать из концлагеря, оба раза был пойман. Бежал при транспортировке в Бухенвальд. Воевал в партизанском отряде.